O Centro de Missões, criado em 1994, tem a finalidade de ser uma escola de treinamento bíblico, ministerial e missionário. Pertence a Convenção das Igrejas Baptistas Independentes (CIBI) em Portugal e surgiu como um projecto missionário dos baptistas independentes no Brasil. O seu fundador foi o pastor Paulo Mendes, missionário da CIBI no Brasil em terras portuguesas.

O Centro de Missões é uma escola que procura conjugar o preparo bíblico com o preparo ministerial e missionário, crendo que o líder evangélico contemporâneo deve ter um bom conhecimento da Palavra de Deus, estar preparado para o exercício de um ministério profícuo e abençoador, e ser uma pessoa envolvida na visão e nos projectos missionários, directa ou indirectamente.

O Centro de Missões é uma escola de orientação evangélica que crê no valor e na actualidade das Sagradas Escrituras, aceita a Declaração de Lausanne e pertence à Convenção das Igrejas Baptistas Independentes, membro da Aliança Evangélica Portuguesa.